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标准物质网——周环酶催化机制研究取得进展
作者:中检航标   转载自:   发布日期:2019-08-16

中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室周佳海课题组和美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)唐奕课题组合作,解析了高分辨率的LepI及其与底物类似物或产物4、5、6的复合物晶体结构,并通过与UCLA的Kendall Houk课题组合作开展理论计算工作,系统地阐释了LepI催化的分子机制。该工作于7月22日在线发表在《自然-化学》(Nature Chemistry)上。周佳海课题组的博士生蔡毓娟、唐奕课题组的博士后Yang Hai和Masao Ohashi并列为论文第一作者。

周环反应在合成领域中非常重要,它能够同时构建多个碳-碳/碳-杂原子键,并且往往具有很高的区域选择性和立体选择性。而新型周环酶的发现及其催化机制的解析,对未来周环反应的开发具有重大的推动意义。但在自然界中,催化周环反应的酶却鲜少报道。

2017年,唐奕课题组报道了一种S-腺苷甲硫氨酸(SAM)依赖的多功能周环酶LepI,它既能催化杂Diels-Alder(HDA)反应,又能催化逆Claisen重排反应(Nature, 2017, DOI: 10.1038/nature23882)。LepI属于O-甲基转移酶家族,但是它却没有甲基转移酶活性。为什么该可以立体选择性地催化脱水反应、HDA反应和逆Claisen重排反应?SAM的作用又是什么?为了回答这些问题,周佳海课题组和唐奕课题组、Kendall Houk课题组合作,进行了深入研究。

LepI蛋白的母体结构通过硒的单波长散射方法被解析。在该结构中,两分子的LepI以N端结构域互相缠绕交错在一起,而C端结构域则是具有O-甲基转移酶家族典型的Rossman折叠这种超二级结构,且每分子的LepI结合一分子辅酶SAM。结合LepI与4、5、6复合物结构以及对过渡态复合物结构的计算和生化实验,该文提出LepI在催化脱水反应过程中,H133作为碱对吡啶酮上的羟基攫氢,R295以及附近的氢键网络促进了这一反应。而在HDA反应和逆Claisen重排反应中,SAM、H133和R295以及活性口袋中的其他极性残基协同作用,产生一个合适的电场,使反应物处于适宜反应发生的取向,稳定过渡态,降低能垒,实现静电催化,促进反应的发生。


关键词:催化,原子,酶,标准物质网
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